هدف از اين درس، آشنایی با مبانی شیمی و کاربرد آنها در سیتمهای زیستی و همچنین کاربرد آنها در روشهای شبیه سازی و طراحی دارو با استفاده از نرم افزارهای براساس روشهای مکانیک کوانتمی و مکانیک ملکولی است.

1. نظریه اتمی
2. ساختار مولکولی ، پیوند و شکل
3. انرژی و آنتالپی
4. گازها
5. خواص محلول
6. تعادل
7. اسیدها و بازها، سینتیک
8. الکتروشیمی
9. جایگزینی هسته دوستی
10. واکنشهای حذفی
11. رادیکال های آزاد
12. پلیمرها
13. نرم‌افزارها: مدل سازی مولکولی
    • بهینه سازی ساختار دارو ، برهمکنش بین مولکولی ، برهمکنش بازهای دی ان ای
    • برهم کنش دارو و پروتئین

• امتحان میان ترم: دوامتحان (هر کدام ۸ نمره)
• امتحان پایانی: تحویل و ارزیابی پروژه (۴ نمره)