تحلیل دادههای حجیم زیستی
Massive Biological Data Analysis
شماره درس: ۴۰۵۵۵ | تعداد واحد: ۳ |
مقطع: کارشناسی ارشد | نوع درس: نظری |
پیشنیاز: – | همنیاز: – |
اهداف درس
هدف از این درس، آشنایی دانشجویان با الگوریتمهای موجود برای تحلیل دادههای حجیم زیستی است. این موارد شامل آمادهسازی کتابخانه، توالییابیهای دنا و رنا، تحلیل برهمکنش دنا و پروتئین و روشهای تکسلولی است.
ریز مواد
- آمادهسازی کتابخانه
- تکنیکهای موجود
- محاسبه پیچیدگی کتابخانه
- توالییابی دنا
- برهم نهی تمام ژنوم
- برهم نهی تمام اگزون
- phase کردن
- توالییابی رنا
- نرمالیزه کردن بیان
- یافتن ژنهای تفریقی
- یافتن شبکههای تنظیمی بیان ژن
- تحلیل برهم کنش دنا و پروتئین
- روشهای نرمالیزه کردن داده
- ChIP-Seq
- ATAC-Seq
- یافتن متیفها
- روشهای تکسلولی
- نرمالیزه کردن دادههای تکسلولی
- دستهبندی دادههای تکسلولی
- پر کردن دادههای تکسلولی
- استنتاج از دادههای تکسلولی
مراجع
- Ye, Shui Qing, ed. Big data analysis for bioinformatics and biomedical discoveries. CRC Press, 2016.