شبکه‌های بیولوژیکی یکی از زمینه‌های جدید است که در آن فرآیندهای سلولی از طریق مدل‌سازی آن‌ها به صورت شبکه‌ای از برهم‌کنش‌های بین مولکول‌ها مورد مطالعه قرار می‌گیرند. تحلیل این شبکه‌ها شامل مسائل آماری و گرافی با کاربردهای مهم در زیست‌شناسی است. درس جاری، روش‌های به روز برای این تحلیل‌ها را ارایه می‌دهد.

1. مقدمه شبکه‌های زیستی
2. آشنایی با گراف‌ها و شبکه‌های زیستی
3. نظریه گراف
4. آشنایی با ابزارهای تحلیل شبکه (Cytoscape)
5. ویژگی‌های عمومی شبکه‌ها
6. معیار مرکزیت (Centrality) شبکه
7. موتیف‌های شبکه
8. خوشه‌بندی شبکه
9. شبکه‌های زیستی و انتقال سیگنال
10. شبکه‌های تنظیم ژنی
11. شبکه‌های برهم‌کنش پروتئینی
12. شبکه‌های متابولیک
13. شبکه‌های فیلوژنی
14. شبکه‌های اکولوژیک
15. شبکه‌های مغز
16. شبکه‌های همبستگی

• کوییز: ۱۰٪
• تمرین: ۲۰٪
• پروژه: ۲۰٪
• آزمون میان‌ترم: ۲۵٪
• آزمون پایان‌ترم: ۲۵٪