تحلیل دادههای حجیم زیستی
Massive Biological Data Analysis
| شماره درس: ۴۰۵۵۵ | تعداد واحد: ۳ | 
| مقطع: کارشناسی ارشد | نوع درس: نظری | 
| پیشنیاز: – | همنیاز: – | 
اهداف درس
هدف از این درس، آشنایی دانشجویان با الگوریتمهای موجود برای تحلیل دادههای حجیم زیستی است. این موارد شامل آمادهسازی کتابخانه، توالییابیهای دنا و رنا، تحلیل برهمکنش دنا و پروتئین و روشهای تکسلولی است.
ریز مواد
- آمادهسازی کتابخانه- تکنیکهای موجود
- محاسبه پیچیدگی کتابخانه
 
- توالییابی دنا- برهم نهی تمام ژنوم
- برهم نهی تمام اگزون
- phase کردن
 
- توالییابی رنا- نرمالیزه کردن بیان
- یافتن ژنهای تفریقی
- یافتن شبکههای تنظیمی بیان ژن
 
- تحلیل برهم کنش دنا و پروتئین- روشهای نرمالیزه کردن داده
- ChIP-Seq
- ATAC-Seq
- یافتن متیفها
 
- روشهای تکسلولی- نرمالیزه کردن دادههای تکسلولی
- دستهبندی دادههای تکسلولی
- پر کردن دادههای تکسلولی
- استنتاج از دادههای تکسلولی
 
مراجع
- Ye, Shui Qing, ed. Big data analysis for bioinformatics and biomedical discoveries. CRC Press, 2016.