• طول دوره و واحدها: طول دوره دو سال‌ می‌باشد.
• تاریخ ارائه عنوان پروژه کارشناسی ارشد حداکثر در پایان نیم‌سال دوم و قبل از شروع نیم‌سال سوم‌ می‌باشد.
• تعداد کل واحدهای دوره پژوهش محور ۲۹ واحد و دوره آموزش محور ۳۲ واحد است:
  • الف: دروس اصلی ۱۲ واحد
  • ب: دروس اختیاری ۹ واحد (۱۸ واحد برای دانشجویان آموزش محور)
  • پ: سمینار ۲ واحد
  • ت: پروژه ۶ واحد (صفر واحد برای دانشجویان آموزش محور)
• در صورتی که دانشجو آموزش محور باشد، ‌ می‌بایستی ۳ درس سه واحدی از مجموعه دروس اصلی یا اختیاری به جای پروژه‌ی ۶ واحدی بگذراند. استاد راهنمای دانشجو تا قبل از انتخاب و تصویب پروژه مدیر گروه بوده و پس از تصویب تعریف پروژه استاد راهنمای پروژه مسئول تایید و راهنمایی دانشجو در اخذ واحدهای درسی‌ می‌باشد.
  
• در صورتی که گذراندن واحدهای جبرانی برای دانشجو ضروری باشد، ‌ می‌بایستی از جدول زیر حداکثر تا پایان نیمسال اول تحصیل با تائید گروه انتخاب واحد نماید. اخذ ۸ واحد جبرانی یا بیشتر امکان افزایش حداکثر یک نیمسال تحصیلی را به سنوات تحصیلی دانشجو فراهم می‌کند. حداقل نمره قبولی درس جبرانی ۱۲ است.

جدول تعداد واحدها و مشخصات آنها در گرایش بیوانفورماتیک به شرح زیر است:

اخذ حداقل ۴ درس (۱۲ واحد) از دروس جدول زیر ضروری است. (دانشجویان نمی‌توانند دروسی را که قبلاً در دوره کارشناسی گرفته‌اند دوباره اخذ نمایند.)

• جمع کل واحدها برای دانشجویان پژوهش محور: ۲۹ واحد = ۹ واحد اصلی + ۱۲ واحد اختیاری + ۲ واحد سمینار + ۶ واحد پروژه
• جمع کل واحدها برای دانشجویان آموزش محور: ۳۲ واحد = ۹ واحد اصلی + ۲۱ واحد اختیاری + ۲ واحد سمینار

تبصره: اخذ دو درس «داده‌کاوی» و «یادگیری ماشین» در طول دوره مجاز نیست و در صورت اخذ هر دو درس توسط دانشجو، یکی از آن‌ها زائد محسوب می‌شود.